Hasta el 31 de diciembre todos los reclamos vinculados con el servicio de la red de Subtes se recibían en la CNRT, a excepción de la línea H que, al depender de la Ciudad desde su orígen, los reclamos se cursaban directamente con SBASE. A partir del 1 de enero de 2013 si un usuario se comunica con la CNRT para elevar un reclamo es derivado a SBASE, donde por el momento existen pocas respuestas.
El GCBA ha dispuesto que todos los reclamos relacionados con el Subte sean concentrados en un único centro de asistencia: el número telefónico 147. También se podrán tramitar reclamos y denuncias a través del Sistema Único de Atención Ciudadana, en el portal web del Gobierno de la Ciudad.